日本国立癌症研究中心的部门由三名外科医生，一名高级住院医师和六名初级住院医生组成。日本国立癌症研究中心对肿瘤的处理包括常见的胃腺癌，食管胃交界的腺癌（AEG：Siewert 2/3型）和胃粘膜下肿瘤（GIST等）。每年，260-300名患者通过开放手术或腹腔镜手术进行手术。腹腔镜胃切除术与根治性淋巴结清扫术于2010年推出，现在日本国立癌症研究中心的部门是日本的主要机构之一。2014年，大约80％的胃切除术是在腹腔镜下进行的，机器人辅助手术也是作为先进的医疗服务系统完成的（政府认可）。日本国立癌症研究中心手术的基础是癌症病变的彻底摘除，但与此同时，应保持器官功能和更好的生活质量（QOL）。此外，日本国立癌症研究中心通过手术结合现代化疗方案，包括与肿瘤内科医生合作的分子靶向药物，努力为患有预后不良疾病（4型胃癌或进行性转移）的患者获得更好的临床结果。
　　 常规活动
　　 通常12-14名患者住院治疗，每周有5至7名患者接受手术。日本国立癌症研究中心部门的临床会议每周举行一次，以决定日本国立癌症研究中心的治疗策略。此外，每周一晚上与诊断放射学，胃肠内窥镜检查和胃肠道肿瘤学的医生举行内科会议，讨论胃肿瘤患者的准确诊断，以确定每位患者的最佳治疗方法。每个星期二早上，都会与医学肿瘤学家举行一次小型会议，讨论边界线病例。原则上，低危浅表性胃癌病变（cT1a）的患者按照指南的标准通过内镜下粘膜下剥离术（ESD）进行治疗。根据通过ESD获得的标本的病理学发现，一些人需要接受完成腹腔镜手术并进行淋巴结清扫术。腹腔镜手术包括远端，近端，幽门保留和全胃切除术。D2剖析也可以在腹腔镜下完成，其对晚期癌症的适用性正在研究中。当肿瘤浸润到邻近器官时，有时会选择延长手术。最近，由于现代化疗方案的进展，有时可以看到cStageIV的降阶段。对于此类患者，日本国立癌症研究中心选择性地进行转换手术以获得有利的结果。对于AEG，在腹腔镜检查下可以安全地使用经鼻方法，手术视野更好。腹腔镜手术包括远端，近端，幽门保留和全胃切除术。D2剖析也可以在腹腔镜下完成，其对晚期癌症的适用性正在研究中。当肿瘤浸润到邻近器官时，有时会选择延长手术。最近，由于现代化疗方案的进展，有时可以看到cStageIV的降阶段。对于此类患者，日本国立癌症研究中心选择性地进行转换手术以获得有利的结果。对于AEG，在腹腔镜检查下可以安全地使用经鼻方法，手术视野更好。腹腔镜手术包括远端，近端，幽门保留和全胃切除术。D2剖析也可以在腹腔镜下完成，其对晚期癌症的适用性正在研究中。当肿瘤浸润到邻近器官时，有时会选择延长手术。最近，由于现代化疗方案的进展，有时可以看到cStageIV的降阶段。对于此类患者，日本国立癌症研究中心选择性地进行转换手术以获得有利的结果。对于AEG，在腹腔镜检查下可以安全地使用经鼻方法，手术视野更好。有时选择扩展操作。最近，由于现代化疗方案的进展，有时可以看到cStageIV的降阶段。对于此类患者，日本国立癌症研究中心选择性地进行转换手术以获得有利的结果。对于AEG，在腹腔镜检查下可以安全地使用经鼻方法，手术视野更好。有时选择扩展操作。最近，由于现代化疗方案的进展，有时可以看到cStageIV的降阶段。对于此类患者，日本国立癌症研究中心选择性地进行转换手术以获得有利的结果。对于AEG，在腹腔镜检查下可以安全地使用经鼻方法，手术视野更好。
　　 研究活动
　　 日本国立癌症研究中心积极在国内或国际会议上公布日本国立癌症研究中心的临床研究数据。此外，日本国立癌症研究中心参加由日本临床肿瘤学组（JCOG） - 胃外科研究组或其他组织进行的多机构临床试验。如果符合每项研究的资格，胃癌患者可以参加其中一项正在进行的临床试验。
　　 临床试验
　　 日本国立癌症研究中心参加2015年的临床试验清单如下
　　 JCOG 1104一项II期试验，确定接受D2胃切除术的病理II期胃癌患者的辅助S-1化疗的最佳时期
　　 JCOG 1401腹腔镜全胃切除/近端胃切除术对临床Ⅰ期胃癌的非随机验证研究
　　 使用达芬奇手术系统（DVSS）（高级医疗服务）评估机器人辅助胃癌根治术的安全性，可行性和经济性的前瞻性研究
　　 JLSSG 0901一项III期随机试验比较开腹和腹腔镜远端胃切除术治疗II / III期胃癌
　　 一项前瞻性随机II期临床试验，比较腹腔镜全胃切除术/近端胃切除术后的球形和线性吻合食管空肠吻合术（与大阪大学合作）
　　 一项前瞻性队列研究，旨在评估食管胃交界癌淋巴结清扫的适当程度
　　 教育
　　 常驻医生接受过专业外科肿瘤学家的培训，他们拥有足够的技术和知识。如今，同时给予他们进行腹腔镜和开放手术的机会。日本国立癌症研究中心还重视其他机构的外科医生教育。2015年，来自国内外医院（来自中国，韩国，菲律宾，西班牙和德国）的外科医生访问了日本国立癌症研究中心的部门，学习外科技术。
　　 前景
　　 日本国立癌症中心将继续努力为远期疾病患者创造更好的生存结果; 对于多学科治疗（化疗，分子靶向药物或免疫检查点抑制剂），与医学肿瘤学家合作至关重要。此外，日本国立癌症研究中心将继续开发低侵入性和高质量的手术方法（腹腔镜或机器人手术），以增加患者的生活质量并实现完全治愈。作为胃癌发生最主要的国家之一，日本国立癌症研究中心有义务扩大日本国立癌症研究中心在全球的知识和经验。