各种诊断技术的最新发展已经导致检测到越来越多的早期和临界恶性肿瘤，并且对于这样的患者，指示了有限的切除保留器官功能。然而，一些疾病，如浸润性导管胰腺癌，晚期胆囊癌和肝门部胆管癌，对于外科医生来说仍然是一项艰巨的挑战，并且仍然与惨淡的长期预后相关。最近，已经开发出用于肝胆和胰腺恶性肿瘤的化学疗法。根据这一发展，已经进行了几项关于具有令人沮丧的预后的恶性肿瘤的辅助性血液疗法的研究。
　　 随着腹腔镜器械的改进和手术经验的进步，腹腔镜手术是选择肝胆胰肿瘤患者的安全替代方案，并且已经实现了其适应症。在日本国立癌症研究中心的部门，自2002年以来进行了腹腔镜肝切除术，并且自2011年以来进行了腹腔镜远端胰腺切除术。
　　 常规活动
　　 日本国立癌症研究中心的小组由四名主治外科医生，三名主要居民和四名居民组成。门诊诊所每周开放五天。工作人员会议每周举行三次，在此期间讨论医疗和外科观点的治疗策略。每周二与放射科医师和肿瘤内科医生合作进行影像诊断病例会议，每月与病理学家一起举行病理学会议。2015年，253例肝胆胰疾病患者接受了手术治疗，包括51例腹腔镜肝切除术和9例腹腔镜远端胰腺切除术。
　　 研究活动
　　 肌肉减少症是一种新发现的脆弱性标志物。日本国立癌症研究中心评估术前肌肉减少症是否对临床相关的术后胰瘘（POPF）形成有影响。本次回顾性研究共纳入了连续266例在2010年至2014年间接受胰十二指肠切除术（PD）的患者。使用术前计算机断层扫描图像测量骨骼肌质量。该研究得出结论，术前肌肉减少症被确定为PD后临床相关POPF形成的强烈且独立的危险因素。
　　 临床试验
　　 JASPAC04是一项关于新辅助化疗的随机II期研究，采用吉西他滨联合治疗和S-1联合S-1和同时放疗治疗切除胰腺癌的患者。招聘始于2014年。
　　 JASPAC05是一项关于新辅助性S-1和同时放疗的II期临床可切除胰腺癌患者的研究。招聘始于2012年。
　　 JCOG1202（ASCOT）是一项III期研究，将S-1与单独手术作为辅助化疗进行比较，用于治疗性胆管癌，包括肝内胆管癌，肝外胆管癌，胆囊癌和壶腹癌。招聘始于2013年。
　　 JCOG0605是一项随机III期临床试验，旨在比较FOLFOX与单独手术作为辅助化疗对于结直肠癌根治性切除的肝转移患者。招聘工作正在进行中。
　　 教育
　　 “董事会认证的专家外科医生”是肝胆胰外科领域的高水平技能。要获得董事会认证的外科医生资格，外科医生必须在董事会认证讲师的指导下执行规定数量的操作。日本国立癌症研究中心部门的居民正在接受培训，以便在主要居民课程结束时获得认证。