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胰腺癌基因组学

  由于胰腺癌的发现较晚,进展迅速且对化学疗法和放射疗法具有抵抗力,因此它是威胁生命的肿瘤。据统计,PanC是美国癌症死亡的第四大原因,中位生存期不到6个月,五年生存率仅为3%。对于那些可能进行根治性切除的患者,其5年生存率仅为20%。发现原因可以控制这种极端恶性行为,这是一个真正的挑战。毫无疑问,在过去的几年中已经取得一些进展,希望基于关键的分子靶标,朝着更有效地治疗癌症的方向发展。这些作为PanC中此类可能性的示例。在遗传学水平上,许多研究已证明PanC患者亲属的风险增加,据估计患者的10%是由于遗传易感性。与这些种系突变相关的PanC的低渗透性可能表明前体病变在恶性进展中的作用,而不是控制正常胰腺细胞开始赘生性生长的限制性事件中的作用。PanC的标志是全基因组范围内的基因组不稳定性,从而导致较大的染色体得失。比较基因组杂交研究表明,非随机染色体畸变最频繁的变化是:获得2q,8q,11q,12p,17q或损失18q,9p或15q。但相对不灵敏,而基于阵列的新型CGH提供更高的空间分辨率,高出20到100倍。使用此测定法,已在广泛使用的胰腺细胞系和胰腺癌样品中鉴定出超过3倍的DNA扩增。最常见的扩增定位于7p12.3、8q24、11q13和20q13。还发现bcl家族的两个新成员,在胰腺癌的背景下尚未对此进行描述。
   在大多数具有20q13扩增的胰腺肿瘤样品中,发现一个新基因,该基因以其细胞因子激活能力而闻名。癌细胞适应缺氧环境的能力越来越被认为是促进肿瘤生长的重要机制。一般认为通过多种细胞机制的改变,肿瘤细胞在疾病的发展过程中变得对缺氧具有抗性。BNIP3是一种可诱导缺氧的促凋亡分子。在缺氧条件下其表达增加,导致缺氧损伤细胞中凋亡程序的激活。然而,与正常的胰腺组织相比,在PanC中BNIP3的表达降低,而其他低氧诱导的基因则没有变化。支持PanC细胞存活的较低表达的原因是BNIP3启动子的高甲基化。甲基化抑制剂5-氮杂2'-脱氧胞苷重新建立PanC细胞对缺氧诱导的细胞死亡的敏感性。
   随着越来越复杂的分子技术的出现,已经寻找人类恶性肿瘤的形态学表现与遗传错误类型之间的相关性的趋势。通常认为,在侵袭性胰腺癌之前,先行依次进行称为PanIN-1A-1B-2和PanIN-3的肿瘤前病变。在微解剖的PanIN早期病变中使用cDNA微阵列Prasad等。已鉴定出与正常导管上皮相比差异表达的49个基因。结果通过半定量和实时PCR,免疫组织化学或原位杂交得到证实。这些基因中的某些通常在胰腺组织中不高水平表达,但已知它们存在于胃和肠的上皮中。此外,其他几个前肠标志物也被上调,其中包括GATA4,GATA5,GATA6,胃泌素,villin1,villin2,HOXA5,SOX2或FKHR6。这些发现可能表明在肿瘤前胰腺导管上皮中出现异常的刺猬信号,这可能暗示胰腺干细胞在癌症发展中的作用。
   IN-1-3从正常胰腺发展胰腺癌的过程中,遗传错误的顺序如下:ERBB2,EGFR1,K-ras,INK4A,TP53,SMAD4/DPC4。APC和B-catenin突变,以及浆液性腺癌中VHL的突变也被描述。另一项研究显示了相似的结果:K-ras突变,p53,DCC丢失,SMAD4/DPC4,p16损失。EGFR表达增加表明预后不良。一项研究反映评估基因表达谱在癌症治疗中的困难,这项研究的主要技术是用于比较正常胰腺组织样本中的表达,正常的十二指肠粘膜,慢性胰腺炎和浸润性胰腺癌。至少有40个基因用两种方法显示出增加的表达,但在这三种方法中只有6个基因:角蛋白19,斯特拉达芬,转谷氨酰胺酶2,视黄酸诱导的3,分泌的白细胞蛋白酶抑制剂,四跨度1.8今天,尚不清楚这些改变的功能意义是什么,以及其中哪些可能成为治疗的潜在目标。尽管正常和肿瘤胰腺中有许多基因表达不同,但很少有基因被翻译成蛋白质。最近使用二维凝胶电泳和质谱法进行的研究表明,以前的研究中鉴定出的许多基因尚未在蛋白质水平上被检测到。然而,另一方面,一些新近检测到且高表达的蛋白质,TM2或S100A8可以用作诊断标记,也可以用于与慢性胰腺炎的鉴别诊断。
   PanC在很大程度上具有化学抗性,对可用的细胞抑制药物的通常反应率通常较低。早就知道,在超过70%的肿瘤中,多药耐药基因和P-糖蛋白10过表达,但耐药表型背后的机制可能要复杂得多。已经在几种人类恶性肿瘤中描述了核因子-kB的组成性活化,包括白血病和淋巴瘤以及诸如前列腺癌,结肠直肠癌和胰腺癌的实体瘤。这些肿瘤细胞表达不同的NF-kB靶基因,赋予其实质性的生长优势,例如抗凋亡基因和细胞周期促进基因。高的NF-kB活性可导致胰腺癌细胞的化学和放射抗性增加,因此抑制NFkB活性可使它们对化学治疗剂敏感。许多调节剂可影响NF-kB通路,许多遗传变化可导致NFkB活性升高。
   糖原合酶激酶3是丝氨酸/苏氨酸激酶,是糖原合成的调节剂。它具有两个同工型:a和B。通常,GSK3B与APC,毒素和B-catenin形成复合物,并磷酸化B-catenin靶向降解。从这个意义上说,GSK-3B是一个促凋亡基因。然而在其他情况下,发现GSK-3B可激活NF-kB,从而有助于细胞存活。已显示,在胰腺癌中,低B-连环蛋白水平与不良预后相关。这一发现与结肠癌中建议的相反。在胰腺癌细胞中可能存在一个活跃的GSK-3B库,该库同时新增加B-catenin的磷酸化和降解,同时激活NF-kB,支持存活和增殖。最近,有人提出PanC细胞中BTRCP1表达的增加有助于IL-1B依赖性的NFkB活化以及化学抗性。白介素-1B赋予永久性NF。胰腺癌中的-kB激活以及深远的化学抗性。激活NF-kB激活的重要步骤是IkBa的降解。降解通过phosphorIkB的多泛素化作用进行,其中限速作用是E3-泛素连接酶的活性。底物特异性取决于67kDaFbox蛋白BTRCP1及其紧密相关的同源物B-TRCP2。这些Fbox蛋白的活性增强可以作为NF-kB激活的恒定抑制因子。在胰腺癌细胞中。
   NF-kB负责放松许多抗凋亡因子,包括bcl-2,bcl-XL,IAP,FAP1,cFLIP,DcRs。已经发现,尽管死亡受体在胰腺细胞系中共表达,但是癌细胞仍然对由这些受体触发的凋亡具有抗性。耐药性主要是由诱饵受体以及bcl-XL和bcl-2的过表达引起的。bcl-XL的抑制作用显着增加了对某些抗肿瘤药和TRAIL的反应。格尔德霉素和PS341协同抑制NF-kB和AKT途径,下调抗凋亡剂,如bcl-2,bcl-XL,cIAP-1和cyclin-D1。提示格尔德霉素,PS-341和TRAIL三联疗法可能是PanC的一种新型治疗方法。出于诊断目的,最好的血清标志物是CA19-9,CA24-2,CA51和CA72-4,而AFP和CEA的敏感性和特异性要低得多。另一项针对160例患者的研究发现,hCG和CA72-4是PanC最有用的血清预后指标。16众所周知PanC经常与血栓形成并发症相关。这就是为什么血小板增多是非常好的临床指标。PanC患者的回顾性分析表明,血小板增多症患者的平均存活率远低于无此症状的患者。尽管这种现象的遗传背景尚不清楚,但最近发现的巨核细胞拟态可能解释血小板数量的增加。
   胰腺腺癌的特征是包含转移抑制因子NME4,凋亡调节因子galectin-3,与转移相关的S100P和S100A6/11,以及基底膜蛋白聚糖,Perlecan和B4整联蛋白的120个基因的特征。签名还包含蛋白水解系统,例如uPA/uPAR和抑制剂Maspin。非常有趣的是,进行中的PanC的基因签名与此完全不同:它包含几种基质蛋白,整联蛋白a5和MMP-2,-11和-14金属蛋白酶。细胞粘附分子E-和N-钙粘着蛋白的丧失与B-catenin功能的改变有关,并且与淋巴和肝转移的风险增加有关。值得注意的是,在PanC的进展过程中,诱导型粘附的表达分子被上调。在主要PanC和进行中PanC之间唯一重叠的特征是uPA/uPAR,这是预后不良的标志。
   DNA倍性,S期分数或Ki-67标记指数等增殖标志物在PanC中不可用。然而,肿瘤抑制因子p27的蛋白表达被证明是预后良好的标志物,基于共有60名患者,并且还有另一个更大的队列支持。胰腺癌经常产生大量粘蛋白,并表达MUC5A和MUC6基因。虽然MUC5A的过表达与淋巴和血源性传播的风险增加有关,但MUC6的过表达支持更长的生存期,这表明MUC基因参与PanC进程的调节。25PanC可能表达EGFR和HER2。免疫组织化学表明,EGFR可以在导管内成分的细胞膜中发现,而在癌的侵入性部分变成细胞质。此外,EGFR的胞质表达在3级肿瘤中更为明显,并且与不良预后相关。单独表达HER2并不是PanC预后的敏感指标,但与AKT激活一起可能是导致PanC失调的原因。除了“常规”蛋白酶外,还有一些其他蛋白酶也参与PanC的进程。结果表明,具有dysintegrin功能的膜蛋白酶ADAM9的表达与预后不良有关。进行PanC过程中的宿主反应并未引起太多关注。在一项分析肿瘤浸润淋巴样亚群的研究中,肿瘤内CD4+和CD8+T细胞的存在与更好的预后相关。
   结缔组织过度产生是胰腺腺癌的常见发现。体外和体内研究提供了证据,胰腺中纤维发生的主要来源是分布在癌周部位的胰腺星状细胞。这些成肌纤维细胞样细胞与肝Ito细胞有一些相似之处:它们可以储存维生素A,表达a平滑肌肌动蛋白和GFAP,并且产生细胞外基质成分,例如胶原I,III,纤连蛋白或层粘连蛋白。已显示许多不同的细胞因子可激活静止细胞:血小板衍生生长因子,TGF-a,TGF-B1,激活素A,碱性成纤维细胞生长因子,肿瘤坏死因子-a或白介素。有趣的是,观察到了积极的反馈,因为PSC本身能够产生TGF-B1,激活素A或IL-1。最近的研究表明,癌细胞与基质成分之间的相互作用指导基因的表达和表达。确定肿瘤的扩散。此外,微环境的改变也可能部分归因于获得性耐药性。胰腺癌中一些细胞外基质蛋白高度表达。例如,在胰腺癌中不存在Galectin-1。正常胰腺和慢性胰腺炎病例,似乎在激活GTP结合状态的H-ras和Kras后调节ras信号通路。因此,galectin-1可以作为新的诊断标记或治疗靶点。
   缺氧可存在于PanC的很大一部分中,从而诱导代谢变化并激活血管生成。PanC的一个特征是HIF1a基因和蛋白的过表达,以及对各自靶基因的刺激。低氧PanC组织中DEC1,己糖激酶II和磷酸葡萄糖异构酶的表达AMF及其同源受体gp78/AMFR参与几种癌症类型的进展,并被认为是黑色素瘤鳞状癌细胞运动的自分泌调节因子。细胞,膀胱癌和前列腺癌。这个问题是否在HIF1a的控制下是一个问题。PanCs的特征是微血管的密度相对不同。血管高密度通常与肝转移的风险和不良的存活率有关。PanC的主要血管生成细胞因子是VEGF-A。bFGF的表达在PanC中也相对频繁,但其单独表达并非预后因素。PanC常表达VEGFR1和VEGFR2,表明形成了独特的自分泌有丝分裂调节环,这可能是新型的靶标抗血管生成治疗。VEGF不仅对内皮细胞有促有丝分裂作用,对PanC细胞也有促有丝分裂作用的观察结果也支持这一观点。PanC的瘤内血管可能表达激活标记,如氨肽酶/CD13。有趣的是,这种激活标记物在肿瘤血管上的存在与微血管密度有关,并被证明是预后不良的标记物。血管生成的天然负调节剂列表不断增加,其中一种是PEDF。大约25%的PanC呈血管抑制物PEDF阳性,这与较低的微血管密度和更长的生存时间相关,这表明在给定癌症中,正负血管生成调节因子净结局相对于新血管生成强度及其重要性对预后的影响。
   PanC的广泛基因组分析揭示许多遗传改变,但是,没有一个作为这种癌症的发生和发展的关键调节因子而出现。因此,如何将这些遗传变化与PanC的经典生物学和临床特征联系起来仍然是一个艰巨的挑战。随着我们的了解的提高,越来越多的遗传改变可以被认为是诊断或治疗的目标。在越来越多的恶性肿瘤中引入此类疗法的结果坚定地支持了这种方法的现实。

 
  索托拉西布  
  索托拉西布是一种KRAS G12C抑制剂,2021年5月获得美国FDA批准,用于治疗先前已接受过至少一种系统疗法、经FDA批准的检测方法证实存在KRAS G12C突变、局部晚期或转移性非小细胞肺癌与胰腺癌患者。成为首个用于KRAS G12C突变的局部晚期或转移性NSCLC患者的靶向疗法。  2021年11月索托拉西布在欧盟获批上市。
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